Söker i databas.......
Image Switcher (Högerklicka för att öppna snabbmenyn)
    Aktuellt
    2014-02-20
    Presentation av DNA-nyckeln
    Presentation av DNA-nyckeln från invigningen av Centrum för genetisk identifiering (
    2014-01-21
    Svenska DNA nyckeln
    Naturhistoriska Riksmuseet anordnar ett seminarium om DNA baserad art- och individidentifiering.
    I Svenska DNA-nyckeln kan man med en frågesekvens söka efter liknande DNA sekvenser i ett referensbibliotek av kända sekvenser. DNA-nyckeln innehåller streckkodsgener och finner man tillräckligt stor likhet mellan sin frågesekvens och en sekvens i DNA-nyckeln så kan man ofta göra en god artbestämning. Om man inte finner någon hög likhet bör man prova andra databaser med ett större urval gener och sekvenser som Genbank och BOLD.

    Observera att referensbiblioteket i Svenska DNA-nyckeln är under uppbyggnad. Svenska arter av fiskar, fåglar och däggdjur är relativt väl representerade men många andra organismgrupper saknas eller har dålig täckning. Läs mer om referensbibliotekets betydelse vid DNA baserad artbestämning.


    Prova DNA-nyckeln genom att klistra in en sekvens, ladda upp en fil eller testa systemet genom att generera en eller flera exempelsekvenser nedan!
    Sekvensdatabas innehållande referenssekvenser hämtade från arter som förekommer i Sverige. Viktigt att notera är att sekvenserna i denna databas kan vara hämtade från individer/prover som är tagna utanför sveriges gränser. Som exempel, om DNA-prov har saknats för en svenskfångad individ av Åkersork, kan sekvensen i databasen härröra från en individ som fångats i Norge. Se Databas.
    Databas innehållande streckkodssekvenser från Svenska ryggradsdjur (COI och 16S), samt sekvenser från databasen Samtliga barkodsekvenser från GenBank som kommer från arter som påträffas i Sverige. Se Databas.
    Databas innehållande streckkodsgener (alla sekvensposter med nyckelordet ”BARCODE”, motsvarar generna COI, rbcL, och matK) hämtade från GenBank, samt alla sekvenser i databasen Svenska ryggradsdjur. Denna databas innehåller således sekvenser från COI, rbcL, matk, samt 16S. Detta är den största databasen i DNA-nyckeln, men samtidigt saknas detaljerad information om sekvensursprung etc för många poster. Se även Databas.

    Platser i Sverige, Norge och Finland där databasernas DNA prov är tagna.
    ----------------------------------------------

    Markör: COI
    Grupp
    DNA
    SWE
    %

    Amfibier
    3
    13
    23.1

    Fåglar
    448
    548
    81.8

    Däggdjur
    83
    103
    80.6

    Fiskar
    186
    256
    72.7

    Reptiler
    4
    7
    57.1
    --------------------------------------------
    Totalt
    724
    927
    78.1
    Markör: 16S
    Grupp
    DNA
    SWE
    %

    Amfibier
    4
    13
    30.8

    Fåglar
    259
    548
    47.3

    Däggdjur
    58
    103
    56.3

    Fiskar
    149
    256
    58.2

    Reptiler
    2
    7
    28.6
    --------------------------------------------
    Totalt
    472
    927
    50.9



    Tabell som beskriver hur stor andel (%) av de svenska arterna av ryggradsdjur (SWE) som är representerade av sekvenser (DNA) i DNA-nyckeln (observera att DNA-nyckeln även innehåller sekvenser från andra organismer än ryggradsdjur).
    Karta
    Linjering
    >  
    No records found.